Exterior de l'església del monestir de Sant Joan de les Abadesses ***

Segons Puig i Cadafalch, l’església fou concebuda com un edifici de planta basilical de tres naus, amb transsepte, i una àmplia capçalera amb absis, girola i capelles radials, seguint una estructura usual a França i especialment a les anomenades esglésies de peregrinació. El pla original no s’arribà a portar a terme per motius desconeguts, tot i que es podria tractar de motius econòmics o de l'existència d'estructures al seus costats, així l'església té únicament una nau molt curta, de manera que a la pràctica és un edifici de creu grega. 

La part dels absis és profusament decorada, per arcuacions i columnetes formant una estructura de dos pisos, tant a l'interior com a l'exterior. La coberta de la capçalera però no és l'original. La volta de canó de la nau s'allarga fins a cobrir l’absis, aguantada per quatre pilars quadrats. La disposició actual és deguda a la reconstrucció pels danys del terratrèmol del dia de la Candelera de l'any 1428, quan el campanar s'esfondrà sobre la girola que envoltava l'absis. 

El terratrèmol de 1428 afectà la capçalera, que ja no va ser reconstruïda a la manera original. Actualment, tres capelles radials s'obren al gran absis central, mentre que un petit absis s'obre a cada braç del creuer.

L'església compta amb tres portals d'entrada, un a cada costat del creuer. El de Sant Mateu, fet l'any 1620, al braç oriental del transsepte, és cobert amb pòrtic amb un segon pis que avui conté l'arxiu. Al costat de ponent hi ha el de Sant Miquel, que comunica amb el claustre gòtic, segurament del segle XII. Al peu de la nau major, al mur de migjorn es va obrir el portal dels Canonges, que juntament amb el de Sant Mateu, estava ricament decorat amb dues columnes i arquivolta el primer i amb quatre columnes i doble arquivolta el segon.